海关查柜是会产生一些额外费用的，但这些费用不是海关收取的，而是码头收取的吊柜费，拆柜费等费用，因为是海关查验才有此费用，码头一般把这些费用称之为海关查验费，码头会开具正规发票的。这些查柜费是由SHIPPER来支付的。一般海关查货前会有查验通知，查验完毕后会有查验报告的。
查验是海关监管的一个重要手段，报关只是一个程序而已，海关会根据自己的经验，当时的政策对一些敏感的品名进行抽查，当然有时候也会是没有任何原因的抽查。查验的时候会打开箱子看，跟报关的资料是否一致，品名，数量，申报货值等等信息，是否有骗税，逃商检，HS编码归类不正确。
海关查验流程
一、海关确定查验后，由现场接单关员打印《查验通知单》，必要时制作查验关封交报关员。
二、安排查验计划。由现场海关查验受理岗位安排查验的具体时间，一般当天安排第二天的查验计划。
三、海关查验货物时，进口货物的收货人、出口货物的发货人或其授权报关员应当到场，并负责协助搬移货物，开拆和重封货物的包装。
四、海关认为必要时，可以径行开验、复验或者提取货样。查验结束后，由陪同人员在《查验记录单》上签名、确认。
海关查验的目的及地点
一、海关查验的目的，一是通过核对实际进出口货物与报关单证来验证申报环节所申报的内容与查验的单、货是否一致，通过实际的查验发现申报审单环节所不能发现的有无瞒报、伪报和申报不实等走私违规事情或其他进出口问题。二是通过查验可以验证申报审单环节提出的疑点，为征税、统计和后续管理提供可靠的监管依据。
二、海关查验的地点一般在海关监管区内的进出口口岸码头、车站、机场、邮局或海关的其他监管场所进行查验。对进出口大宗散货、危险品、鲜活商品、落驳运输的货物，经进出口收发货人的申请，海关也可在作业现场予以查验放行。在特殊情况下，经进出口收发货人或其代理人申请，海关审核同意，也可派员到规定的时间和场外的工厂、仓库或施工工地查验货物。
