保税区一日游的操作流程主要包括以下步骤：
前期准备
资料准备：出口方需提供合同、发票、装箱单、报关草单等资料，若为手册出口，提供报关草单、装箱单扫描件、发票扫描件；若一般贸易出口总价不超五万美元，提供报关草单、装箱单扫描件、发票扫描件，总价五万美元及以上则需提供报关草单、装箱单正本、发票正本、合同正本、增值税发票复印件、出口专用发票正本。进口方若为手册进口，需提供报关草单、装箱单扫描件、发票扫描件；一般贸易进口则需提供报关草单、装箱单正本、发票正本、合同正本.
计划备案：对于需要进行深加工结转的企业，转入和转出企业都要向各自的主管海关提交保税加工货物深加工结转申请表，申报结转计划。转出企业在申请表填写本企业的转出计划并签章，凭申请表向转出地海关备案；转出地海关备案后，留存申请表联，其余三联退回转出企业交转入企业；转入企业在转出地海关备案之日起20日内，持申请表其余三联，填制本企业的相关内容后，向转入地海关办理备案手续并签章；转入地海关审核后，留存第二联，第三、四联交转入、转出企业凭以办理结转收发货登记及报关手续.
货物运输
拖车安排：根据客户交单情况，安排拖车前往发货工厂拖货，并确保车辆及司机具备相应的资质和证件.
车辆入区：拖车将货物运输至保税区，在海关监管下，车辆进入保税区闸口。司机需向海关提交相关报关资料，海关核对车辆信息、货物信息与报关单是否一致，经查验无误后，予以放行，车辆进入保税区.
出口报关
报关申报：出口企业或其代理报关行根据提供的报关资料，在海关系统中录入出口报关单信息，包括货物的名称、数量、价值、海关编码等，并向海关申报.
海关审核：海关对出口报关单及相关资料进行审核，如审核通过，则给予出口放行通知，允许货物在保税区内进行流转.
进口报关
报关申报：进口企业或其代理报关行在货物进入保税区后，根据进口报关资料，在海关系统中录入进口报关单信息，并向海关申报进口.
海关审核与征税：海关对进口报关单及相关资料进行审核，确定货物的完税价格，并根据相关税率计算应征税款。进口企业或其代理报关行需按照海关要求缴纳相应税款后，海关才会给予进口放行通知.
货物提离
安排拖车：在完成进口报关手续并获得放行通知后，安排拖车进入保税区提柜.
工厂卸货：拖车将货物运输至指定的工厂或仓库，完成卸货，至此，保税区一日游流程结束.
