功能性肠病是一组消化系统疾病，在普通人群中患病率达34.6%。生活中比较常见的功能性肠病包括功能性肠道消化不良、功能性便秘、功能性腹泻等。肠道内环境的恶化会导致便秘、腹泻等，主要是因为饮食不规律、生活习惯紊乱、精神紧张等原因引起的。如果精神压力过大，会导致交感神经紧张，从而导致肠道蠕动情况变差。如此一来，有益菌的数量就会减少，而肠道中的有害菌数量增加，肠道细菌的作用整体降低，造粪功能也会随之下降。从而导致便秘或者腹泻。女性更容易出现便秘，男性更容易拉肚子。 如何判断自己的肠道菌群是否健康大便形状：研究表明大便形状与微生物多样性密切相关。可使用布里斯托粪便量表评估自己的大便形状是否健康。 红细胞和尿酸：可以通过体检检查结果来判断红细胞和尿酸是否正常。年龄，药物使用，排便习惯：年轻、不滥用抗生素、排便习惯良好的人，自然会有良好的肠道菌群。肠道菌群
肠道菌群移植（FMT）可长期有效治疗便秘，《ScienceChina》上发表的一项研究表明，肠道菌群移植联合可溶性纤维补充剂用于治疗便秘，具有较高的临床缓解率和较少的副作用。肠道菌群移植（FMT）改善抗生素相关性腹泻，《CriticalCare》上发表的一项关于抗生素相关性腹泻患者接受FMT治疗的研究结果。研究初步表明了FMT治疗抗生素相关性腹泻的安全性，揭示了肠道菌群移植治疗在这些患者中的潜在治疗作用。 肠道与大脑通过“微生物-脑-肠”轴形成一个双向沟通的渠道，大脑可以通过这一途径改变肠道菌群的丰度和多样性，而肠道菌群也可以反过来影响宿主的精神、神经等功能状态。而功能性肠病就是典型的因肠道菌群失衡后导致的肠道功能障碍性疾病。目前，肠菌群移植在治疗艰难梭菌感染、溃疡性肠炎、肠易激综合征等方面具有很好的临床价值，并有很好的发展前景。