相比较无机肥料的有规模的工业化生产，有机肥料从原料来源上就较为复杂。有机肥料多是一些动植物残体、动物的粪便以及一些生活垃圾等物质生产出来的。这也就导致了很多有机肥料产品在杂菌率、蛔虫卵死亡率、粪大肠菌群数等菌落指标上很容易超标。而有机肥料如果菌落超标，不仅可能其养分成分植物得不到吸收，甚至一些寄生虫由此进入农作物体内，而人们一旦食用了这种带有寄生虫的农作物，对身体健康便可能产生一定危害。有机肥料在生产上对污染物限量指标的控制，也就成为保证农业生产安全的重要因素。
那么，如何知道污染物限量指标的多少呢？这自然离不开对有机肥料的检测。对有机肥料进行检测，不仅能够了解有机肥料的质量情况，对于有机肥料在腐熟、发酵、除臭等资源化利用关键技术的攻克，都有参考价值。我们通过检测报告，还可也分析解决有机肥料在生产加工中面临的脱水、灭菌、烘干、造粒等问题。
除了蛔虫卵死亡率、粪大肠菌群数等污染物检测项目外，有机肥料可以检测以下项目
1、有机肥料物理性能检测项目主要有：磨耗率、粒度、抗压碎、细度、水分、pH值（酸碱度）
2、有机肥料有效成分检测项目主要有：总养分（氮+五氧化二磷+氧化钾）的质量分数、总氮含量、钾含量、磷含量、氨基酸、有机质含量等
3、有机肥料微量元素检测项目主要有：钙、铜、铁、镁、锰、锌、硒、氟等
4、有机肥料重金属检测项目主要有：总铅、总铬、总镉、总汞、总砷等
5、有机肥料抗菌类药物检测项目主要有：土霉素、四环素、金霉素、强力霉素、磺an类药物等
6、有机肥料其他含量检测项目主要有：腐植酸、硫suan盐含量、亚甲基二脲含量、不溶物含量等
在了解了检测项目后，有机肥料的检测标准又有哪些呢？
有机肥料检测标准主要有：
NY 525-2012 有机肥料
NY 884-2012 生物有机肥
HG/T 5332-2018 腐植酸生物有机肥
NY/T 1868-2010 肥料合理使用准则 有机肥料
NY/T 300-1995 有机肥料速效磷的测定
NY/T 301-1995 有机肥料速效钾的测定
NY/T 302-1995 有机肥料水分的测定
NY/T 303-1995 有机肥料粗灰分的测定
NY/T 304-1995 有机肥料有机物总量的测定
NY/T 3167-2017 有机肥中磺an类药物含量的测定 液相色谱-串联质谱法
NY/T 3161-2017 有机肥料中砷、镉、铬、铅、汞、铜、锰、镍、歆、锶、钴的测定
GB/T 32951-2016 有机肥料中土霉素、四环素、金霉素与强力霉素的含量测定 高效液相色谱法