印度尼西亚商标注册的流程包括以下步骤：
1.提交申请：由商标代理机构向印尼商标局提交印度尼西亚商标注册申请，每份申请只能包括一个类别的商品或服务，对每类商品或服务须分别提交申请。提交申请后，如果符合要求，将授予申请日期和申请号。
2.形式审查：印尼商标局在接到印度尼西亚商标注册申请后，将进行形式审查。形式审查将在正式接收申请后的15天内完成，形式审查的主要目的是审查申请文件是否齐备，如果文件不齐备，商标代理机构可在接到形式审查驳回通知书后的2个月内补齐所缺文件。
3.公告：印尼商标局对符合要求的印度尼西亚商标注册申请，自申请完成之日起算的14天内予以公告，公告期为3个月，任何利害关系人都可以在公告期内对被公告的商标提出异议。
4. 实质审查：实质审查过程中，审查员将从以下两方面对该印度尼西亚商标注册申请进行充分审查：
（1）商标是否是可以注册的标识；
（2）商标是否是应该予以驳回的标识。
另外，印尼商标法也规定了实质审查完成的审限为9个月内。
5.答辩：如经审查有不得注册事项，商标申请将被核驳，申请人在收到“核驳通知”后，须于30个工作日内提出书面答辩。答辩成功，DJKI则会核发“商标注册证”。如驳回答辩，申请人可于90个工作日申请复审。如进行听证后复审委员会仍决定驳回申请，申请人可在3个月内向法院上诉。
6. 核准注册：经审查无不得注册事由，DJKI将核发“商标注册证”。
至于费用方面，具体费用可能因机构和代理人的不同而有所差异。因此，建议在选择代理机构时详细咨询其收费标准和服务内容。
请注意，以上流程仅供参考，具体的流程和费用可能因实际情况而有所不同。因此，在决定进行印度尼西亚商标注册前，建议详细了解相关法律法规和程序，并咨询专业机构或律师的意见。
