购进农副产品养殖系统如何抵扣进项税？四种进项税额抵扣方法：取得的一般纳税人开具的增值税专用发票或海关专用缴款书，按照发票票面税额抵扣。取得的小规模纳税人开具的3%征收率的增值税专用发票，自年4月1日起，按照票面金额和9%的扣除率计算抵扣进项税。
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取得农产品收购发票或销售发票的，按照注明的买价和9%扣除率计算进项税额。纳税人购进的农产品如果用于生产13%税率的货物的，除按以上办法抵扣进项税额外，还可以在领用当期计算加计扣除1%的进项税额。
根据《财政部税务总局海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部税务总局海关总署公告年第39号）规定，纳税人购进农产品，原适用10%扣除率的，扣除率调整为9%。纳税人购进用于生产或者委托加工13%税率货物的农产品，按照10%的扣除率计算进项税额。
了解当地种植业产业特色，对当地特产的农副土特产品进行划分，具体可根据时间品种进行划分，区分产品来源为种植业厂或养殖业，并了解每个时间段的农副土产品的产量。