超净台的空气循环有两种模式：开环和闭环。
开环空气循环模式如下
其主要特征是在每次循环中所有空气从外界采入并Zui终都回到环境中去，一般水平流的超净工作台都采用开环模式。这种模式的超净工作台结构较简单，成本低廉，但是风机和过滤器的负载较大，对其寿命会产生不良影响。同时完全开环的空气循环的洁净效率不高，且外排的空气可能会携带部分样本中的细菌等，可能会对环境造成危害。通常只用于洁净要求较低的或是无生物危害的场合。
闭环空气循环模式如下
其主要特征是在每次循环中所有空气从外界采入并Zui终都回到环境中去，一般水平流的超净工作台都采用开环模式。这种模式的超净工作台结构较简单，成本低廉，但是风机和过滤器的负载较大，对其寿命会产生不良影响。同时完全开环的空气循环的洁净效率不高，且外排的空气可能会携带部分样本中的细菌等，可能会对环境造成危害。通常只用于洁净要求较低的或是无生物危害的场合。
可见，闭环模式其实也不是完全封闭的气流循环，每次循环中将有的空气排放到环境空间，但这些外排的气体已经过一个外排高效空气过滤器的过滤。70%的气体流过工作区域后经导流孔重新进入下一个循环过程，较外界吸入的空气而言，这些气体还是比较纯净的，这样过滤器的负载就较小，寿命也会较长。这种空气循环模式为目前主流产品所采用。
