【呼和浩特航空口岸】
呼和浩特白塔国际机场是内蒙古自治区首府机场，位于呼和浩特东郊，距离市中心约15公里，1958年10月建成通航。白塔国际机场是内蒙古自治区唯一的干线机场，首都机场的主要备降机场，同时也是国家重点建设的12个干线机场之一。1991年12月被国务院批准为航空口岸机场，机场飞行区等级为4E级。航站楼建筑面积10.6万平方米，机位70个，廊桥22部，值机柜台47个，安检通道24条。开通日本、韩国、泰国、新加坡、缅甸、越南、柬埔寨、俄罗斯、格鲁吉亚、哈萨克斯坦、蒙古国、香港、台湾等13个国家和地区的26条国际、地区航线。2022年受疫情影响，白塔国际机场全年旅客吞吐量453.9万人次，货运吞吐量3.01万吨。2023年1-6月份，呼和浩特白塔航空口岸出入境国际航班起降101架次，同比增长9.1倍；出入境旅客4296人次，同比增长1.3倍。国际快件清关量72.4万件，716.2吨，同比增长69.4%。
【海拉尔航空口岸】
海拉尔航空口岸位于呼伦贝尔东山国际机场。1993年7月国务院同意海拉尔航空口岸对外开放，是一类航空口岸。1995年9月正式对外开放，现机场级别为4D，跑道长度2800米，共有18个停机位。国内候机楼建筑面积7655平方米，2016年海拉尔航空口岸改扩建国际候机楼，国际候机楼建筑面积达到3490平方米。
海拉尔航空口岸相继开通了海拉尔至赤塔、乌兰巴托、台北等多条国际及地区航线，具备办理外籍人员入境签证、台湾籍人员入境签注及一次性的台胞证发放业务。2019年执行出入境航班469架次、出入境人员3.85万人次，同比增长392.1%，创下海拉尔航空口岸历史高纪录。自2023年5月逐步恢复国际航线飞行，目前已开通了蒙古国乌兰巴托、俄罗斯赤塔国际航线。
【满洲里航空口岸】
满洲里西郊国际机场2005年8月实现临时开放。2009年2月国务院批复同意对外开放。机场候机楼面积2万平方米，跑道2800米，机场飞行区等级为4D级，3条廊桥，可满足国内国际进出港旅客200万人次，高峰小时1400人次的需求。近年受**肺炎疫情影响满洲里航空口岸暂停通关。自2023年3月逐步恢复国际航线飞行，目前开通有蒙古国乌兰巴托、俄罗斯伊尔库茨克和新西伯利亚国际航线。2023年上半年，进出境旅客0.3万人次。
【鄂尔多斯航空口岸】
2012年国务院同意将鄂尔多斯伊金霍洛机场补列入国家“十二五”口岸发展规划。鄂尔多斯航空口岸列入国家2013年度审理计划，同年4月2日，国家口岸办批复同意鄂尔多斯机场于2013年至2015年实现临时开放。2016年1月18日，国务院以国函〔2016〕24号文件批复同意鄂尔多斯伊金霍洛机场作为航空口岸对外开放。11月国家验收组对口岸对外开放进行了验收。
2019年，11月20日海关总署批复同意鄂尔多斯航空口岸设立进境水果、食用水生动物和进口冰鲜水产品指定监管场地，是内蒙古自治区、呼包鄂榆城市群家该类别指定监管场地，2023年6月30日正式通过验收。
【包头航空口岸】
包头航空口岸位于东河区，距主城区23公里，2016年6月获准临时开放。2019年11月8日国务院批复同意对外开放，航站楼建筑面积达1.1万平方米，为4D级国际支线机场。开通包头至蒙古、泰国、越南、韩国和香港等国家、地区的12条国际航线，累计起降国际航班1253架次，出入境旅客129756人次，年均国际旅客吞吐量突破3.3万人次。
【二连浩特航空口岸】
二连浩特航空口岸是依托赛乌素机场而建，该机场位于市区东南27公里处，2010年正式通航，飞行区等级4C。自通航以来，航线网络逐步完善，由初的2条发展到多的13条，包括国内的10条和国际的蒙、俄3条，自2013年连续7年实现临时开放，2021年9月国务院批复为航空口岸。
