生物有机肥是以畜禽粪便、生活垃圾、农作物秸秆、农副产品和食品加工产生的有机废弃物为原料，配以多功能发酵菌种剂，快速除臭、腐熟、脱水后，再添加功能性生物菌种剂加工而成的含有一定量功能性微生物的有机肥料。它符合生产安全、无公害绿色农产品的肥料原则要求。
育苗营养土要求质地疏松，透气性好，养分充足，保水保肥性强。一般用生物有机肥配制育苗营养土的方法为：用熟化、肥沃、没有种过茄果类的菜园土60％、细沙20％、生物有机肥20％，混合均匀后过筛，并加入适量的氮磷钾速效养分。
土壤生物学指标：菌落总数、大肠菌群、大肠杆菌、霉菌、酵母菌等各类常规微生物
肠杆菌科、嗜渗酵母、粪链球菌、粪大肠菌群、肠杆菌属等非常规微生物
微生物量碳、微生物量氮、生物多样性等
脲酶、过氧化氢酶、磷酸酶、蔗糖酶、纤维素酶、蛋白酶等
有机质、胡敏酸、富里酸、腐殖质
土壤污染物指标：各类农药残留检测、各类抗生素检测
土壤营养指标：有机质、全氮、速效钾、速效磷、速效氮、酸碱度、碳氮比、阳离子交换量
土壤代谢组学分析：土壤中各类代谢物分析
检测标准：
《土壤农业分析》、各类国家标准、各林业标准、各农业标准、各类国内外文献方法
