由于水污染在水体中的表现是不均匀的，采样也是在动态的水体中进行，如何在流动式的水体中采集到具有代表性、能真实反映污染水平的试样，做好水质检测分析，应在以下几个环节中做好质量控制工作。
掌握监测河段的水文特征、河流运动特点。
水质监测必须通过有效的采样方法和科学的布点原则，准确寻找所排放的污染物在水体中均匀分布的断面和采样点位置，以合理的采样频率，采集具有代表性的水样，从而能以较少的采样断面和水样，来获取足以反映河流水质污染水平的信息。
对于一般小的河流，上述工作并不复杂，而对于较大的河流，则因所排放的污水量相对于河水流量来说为较小，往往容易在岸边形成较长的污染带，遂使污染物和河水充分混合的断面离污染源较远。因此，在确定采样断面时，必须充分考虑到这点。
污染物和河水的充分混合受多种因素牵制，从整个流域看，河床的形态、坡降、糙度、河道变化和河水流速决定了河水的力学性质，导致了水质点的不同运动方式，也决定了污染物纵向、横向的不同变化特点和污染物在水体中的不同扩散能力。
河流按其运动特点可分为流速大的主流带、近岸滞流带和处于主流、滞流之间的过渡带。主流带是河床断面水流速度Zui大的部份，在河床的地形、糙度、河道弯曲及礁石影响下，有助于水紊流运动的产生。随着水质点的不断向前推进，过渡带、滞流带的水质点不断向主流带方向移动，Zui终达到棍合。如不了解河水运动的特点，不掌握污染带的生、消规律，而在污染物尚未与河水充分混合的位置布设采样断面和采样点，则所汲取的污染物浓度信息就不能反映该河流的污染水平。可见，掌握河流水文地质资料，了解污染物稀释扩散规律，对于采样断面的合理布设，是必不可少的基础工作。